使用有機肥設備生產的有機肥料能夠滅殺糞便中的病毒、病菌、蟲卵、雜草種子等，有效遏制土壤中的病蟲害發生，減少其他農藥用量；由于其中含有豐富的有機質和腐殖質，因此能有效的提高肥料的固氮能力和磷的水溶性，促進植物的吸收。

    把用有機肥設備生產的有機肥料施入土壤后，能保持土壤良好的團粒結構，同時能刺激作物體內各種酶的活性，加快作物的生長。根據形成的有益的優勢菌群能抑制和減少病毒菌的產生，減少病害，增加植物活性。

     其次，有機肥設備生產的有機肥料在活化土壤，改善土壤板結和養分流失方面也有顯著的效果。憑借這一點，土壤通透性和可耕性都能有明顯的提高，增強抗旱能力，即便是很少的投入也有可能得到高產量，增產效果顯著。

    有機肥設備生產的有機肥料的利用率也是比較高的，因此提高了土壤的PH值，并長久保持穩定，使得土壤的耐肥、耐鹽堿能力增加，養分全面，促進作物新陳代謝，改善品質，增強抗病能力。

    由于在有機肥設備的作用下，有機肥已經充分腐熟，因此兼有多種生物活性，這些是化肥所無法比擬的，施用后能自然能夠改善農產品品質。